Căn cứ Quyết định số 4943/QĐ-BGDĐT ngày 30/10/2015; Quyết định số 1768/QĐ-BGDĐT ngày 19/05/2017; Quyết định số 4939/QĐ-BGDĐT ngày 23/11/2017 của Bộ trưởng Giáo dục và Đào tạo cho phép Trường Đại học Hùng Vương đào tạo trình độ thạc sĩ 07 chuyên ngành;
1. Quản lý kinh tế - Mã số: 8340410
2. Lý luận và phương pháp dạy học bộ môn toán - Mã số: 8140111
3. Lý luận văn học - Mã số: 8220120
4. Giáo dục học (Tiểu học) - Mã số: 8140101
5. Sinh học - Mã số: 8420101
6. Chăn nuôi - Mã số: 8620105
7. Khoa học cây trồng - Mã số: 8620110
Chương trình đào tạo trình độ thạc sĩ các ngành:
1. Lý luận và phương pháp dạy học bộ môn toán (mã số: 8140111)
2. Lý luận văn học (mã số: 8220120)
3. Quản lý kinh tế (mã số: 8340410)
4. Giáo dục học - Tiểu học (mã số: 8140101)
5. Sinh học - Mã số: 8420101
6. Chăn nuôi (mã số: 8620105)
7. Khoa học cây trồng (mã số: 8620110)
Chuẩn đầu ra là quy định về nội dung kiến thức chuyên môn; kỹ năng thực hành, khả năng nhận thức công nghệ và giải quyết vấn đề; công việc mà người học có thể đảm nhận sau khi tốt nghiệp và các yêu cầu đặc thù khác đối với từng trình độ, ngành đào tạo.
Trường Đại học Hùng Vương cam kết chuẩn đầu ra các ngành Thạc sĩ, cụ thể như sau:
1. Thạc sĩ Lý luận và PPDH bộ môn Toán
2. Thạc sĩ Lý luận văn học
3. Quản lý kinh tế
4. Giáo dục học (Tiểu học)
5. Sinh học
6. Chăn nuôi
7. Khoa học cây trồng
Trường Đại học Hùng Vương quy đinh mức thu học phí hệ đào tạo thạc sỹ năm học 2020 - 2021 như sau:
+ Nhóm ngành khoa học xã hội, kinh tế, luật: 490.000 đồng / tín chỉ.
+ Nhóm ngành nông, lâm, thủy sản: 345.000 đồng / tín chỉ.
+ Nhóm ngành khoa học tự nhiên, công nghệ, thể dục thể thao, khách sạn, du lịch: 585.000 đồng / tín chỉ.